Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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