Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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