Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms