Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Gm20795J3QP49 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms