Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms