Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Speer3W4VSP1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms