Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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