Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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