Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5oQ9DB20 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp5oQ9DB20 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms