Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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