Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Apobec3Q99J72 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Apobec3Q99J72 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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