Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms