Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms