Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim35Q8C006 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700030L20Rik-201ENSMUST00000189233 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms