Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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