Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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