Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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BB287469Q3UT53 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BB287469Q3UT53 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BB287469Q3UT53 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BB287469Q3UT53 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BB287469Q3UT53 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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