Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms