Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21bQ0HA38 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms