Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SgcdP82347 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SgcdP82347 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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