Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm43795-201ENSMUST00000202051 2366 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Irx2P81066 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms