Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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