Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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