Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hoxa10P31310 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Hoxa10P31310 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Hoxa10P31310 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa10P31310 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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