Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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