Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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