Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms