Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18524 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18524 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18524 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms