Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms