Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms