Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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