Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms