Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ism1A2ATD1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms