Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5114W4VSN8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5114W4VSN8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms