Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms