Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clic1Q9Z1Q5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clic1Q9Z1Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms