Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3bQ9Z1N7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid3bQ9Z1N7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arid3bQ9Z1N7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms