Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sumo3Q9Z172 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms