Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema4fQ9Z123 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema4fQ9Z123 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms