Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn3Q9Z0Y1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms