Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn2Q9Z0R6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn2Q9Z0R6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn2Q9Z0R6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms