Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc1bQ9WV32 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc1bQ9WV32 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms