Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms