Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb2Q9R1P3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb2Q9R1P3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms