Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc26a4Q9R155 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a4Q9R155 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms