Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod1Q9R0E2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms