Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr54Q9R0D8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Wdr54Q9R0D8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms