Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab1Q9R078 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms