Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClnkQ9QZE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms