Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms